Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdcd1Q02242 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms