Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec23aQ01405 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms