Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Top2aQ01320 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms