Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Grin2bQ01097 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms