Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou1f1Q00286 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou1f1Q00286 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou1f1Q00286 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou1f1Q00286 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou1f1Q00286 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou1f1Q00286 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou1f1Q00286 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou1f1Q00286 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou1f1Q00286 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou1f1Q00286 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou1f1Q00286 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou1f1Q00286 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou1f1Q00286 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou1f1Q00286 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms