Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc1P98083 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc1P98083 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc1P98083 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc1P98083 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc1P98083 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc1P98083 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc1P98083 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc1P98083 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc1P98083 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc1P98083 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc1P98083 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc1P98083 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms