Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3aP97351 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3aP97351 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3aP97351 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3aP97351 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3aP97351 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3aP97351 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3aP97351 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3aP97351 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3aP97351 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3aP97351 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3aP97351 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3aP97351 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3aP97351 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3aP97351 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps3aP97351 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps3aP97351 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps3aP97351 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps3aP97351 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps3aP97351 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps3aP97351 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps3aP97351 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms