Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms