Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufd1P70362 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms