Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdlim4P70271 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms