Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps17P63276 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps17P63276 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps17P63276 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps17P63276 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps17P63276 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps17P63276 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps17P63276 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps17P63276 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps17P63276 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms