Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl30P62889 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms