Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhobP62746 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhobP62746 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhobP62746 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhobP62746 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhobP62746 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhobP62746 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhobP62746 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhobP62746 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhobP62746 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhobP62746 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhobP62746 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhobP62746 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhobP62746 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhobP62746 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhobP62746 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RhobP62746 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhobP62746 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhobP62746 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhobP62746 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RhobP62746 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhobP62746 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhobP62746 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhobP62746 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhobP62746 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhobP62746 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhobP62746 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhobP62746 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhobP62746 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhobP62746 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhobP62746 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhobP62746 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhobP62746 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhobP62746 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhobP62746 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhobP62746 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhobP62746 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RhobP62746 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhobP62746 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhobP62746 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RhobP62746 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhobP62746 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhobP62746 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhobP62746 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhobP62746 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhobP62746 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhobP62746 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhobP62746 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhobP62746 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhobP62746 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhobP62746 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RhobP62746 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhobP62746 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhobP62746 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhobP62746 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhobP62746 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhobP62746 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhobP62746 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhobP62746 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhobP62746 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhobP62746 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhobP62746 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhobP62746 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhobP62746 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhobP62746 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhobP62746 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhobP62746 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhobP62746 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhobP62746 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhobP62746 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhobP62746 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhobP62746 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhobP62746 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms