Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smg6P61406 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smg6P61406 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Smg6P61406 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smg6P61406 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smg6P61406 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smg6P61406 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smg6P61406 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms