Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgf1P61148 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fgf1P61148 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms