Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PlnP61014 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PlnP61014 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PlnP61014 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PlnP61014 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PlnP61014 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PlnP61014 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PlnP61014 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PlnP61014 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PlnP61014 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PlnP61014 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PlnP61014 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PlnP61014 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PlnP61014 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PlnP61014 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PlnP61014 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PlnP61014 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PlnP61014 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PlnP61014 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PlnP61014 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PlnP61014 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PlnP61014 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PlnP61014 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PlnP61014 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PlnP61014 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PlnP61014 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PlnP61014 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PlnP61014 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PlnP61014 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PlnP61014 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PlnP61014 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PlnP61014 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PlnP61014 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PlnP61014 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PlnP61014 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PlnP61014 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PlnP61014 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PlnP61014 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PlnP61014 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PlnP61014 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PlnP61014 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PlnP61014 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PlnP61014 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PlnP61014 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PlnP61014 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PlnP61014 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PlnP61014 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PlnP61014 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PlnP61014 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PlnP61014 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PlnP61014 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PlnP61014 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms