Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfia3P60469 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms