Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctdsp1P58466 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms