Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gsc2P56916 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms