Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sssca1P56873 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sssca1P56873 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sssca1P56873 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sssca1P56873 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sssca1P56873 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sssca1P56873 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms