Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms