Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp5P56399 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp5P56399 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp5P56399 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp5P56399 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp5P56399 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp5P56399 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp5P56399 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp5P56399 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp5P56399 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms