Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpc4P51655 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc4P51655 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc4P51655 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc4P51655 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc4P51655 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc4P51655 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc4P51655 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc4P51655 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc4P51655 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc4P51655 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc4P51655 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc4P51655 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms