Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms