Protein–RNA interactions for Protein: P49582

Chrna7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna7P49582 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms