Protein–RNA interactions for Protein: P49003

Bmp5, Bone morphogenetic protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp5P49003 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp5P49003 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp5P49003 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms