Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl11P48298 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms