Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbx2P48031 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms