Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrprbP47758 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrprbP47758 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SrprbP47758 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SrprbP47758 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrprbP47758 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrprbP47758 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrprbP47758 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrprbP47758 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms