Protein–RNA interactions for Protein: P43300

Egr3, Early growth response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr3P43300 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr3P43300 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Egr3P43300 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms