Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NodalP43021 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NodalP43021 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NodalP43021 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NodalP43021 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NodalP43021 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NodalP43021 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NodalP43021 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NodalP43021 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NodalP43021 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NodalP43021 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NodalP43021 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NodalP43021 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NodalP43021 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NodalP43021 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NodalP43021 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NodalP43021 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NodalP43021 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NodalP43021 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NodalP43021 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NodalP43021 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NodalP43021 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NodalP43021 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NodalP43021 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NodalP43021 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NodalP43021 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NodalP43021 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NodalP43021 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NodalP43021 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NodalP43021 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NodalP43021 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NodalP43021 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NodalP43021 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NodalP43021 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NodalP43021 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NodalP43021 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NodalP43021 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NodalP43021 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NodalP43021 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NodalP43021 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NodalP43021 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NodalP43021 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NodalP43021 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NodalP43021 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NodalP43021 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NodalP43021 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NodalP43021 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NodalP43021 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NodalP43021 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NodalP43021 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NodalP43021 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NodalP43021 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NodalP43021 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NodalP43021 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NodalP43021 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NodalP43021 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NodalP43021 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NodalP43021 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NodalP43021 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NodalP43021 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NodalP43021 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NodalP43021 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NodalP43021 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NodalP43021 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NodalP43021 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NodalP43021 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NodalP43021 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NodalP43021 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NodalP43021 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NodalP43021 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NodalP43021 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NodalP43021 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NodalP43021 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NodalP43021 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NodalP43021 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NodalP43021 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NodalP43021 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NodalP43021 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NodalP43021 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NodalP43021 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NodalP43021 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NodalP43021 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms