Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms