Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms