Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tac1P41539 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tac1P41539 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tac1P41539 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tac1P41539 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tac1P41539 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tac1P41539 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tac1P41539 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tac1P41539 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tac1P41539 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tac1P41539 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tac1P41539 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tac1P41539 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tac1P41539 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tac1P41539 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms