Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf1P39428 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf1P39428 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf1P39428 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf1P39428 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf1P39428 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf1P39428 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf1P39428 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf1P39428 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf1P39428 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf1P39428 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf1P39428 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf1P39428 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf1P39428 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf1P39428 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf1P39428 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf1P39428 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf1P39428 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf1P39428 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf1P39428 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf1P39428 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf1P39428 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf1P39428 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf1P39428 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf1P39428 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf1P39428 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf1P39428 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf1P39428 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Traf1P39428 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Traf1P39428 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf1P39428 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf1P39428 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf1P39428 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf1P39428 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf1P39428 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms