Protein–RNA interactions for Protein: P35761

Ttk, Dual specificity protein kinase TTK, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtkP35761 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtkP35761 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtkP35761 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TtkP35761 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtkP35761 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TtkP35761 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TtkP35761 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtkP35761 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtkP35761 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtkP35761 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtkP35761 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtkP35761 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TtkP35761 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtkP35761 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtkP35761 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtkP35761 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtkP35761 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtkP35761 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtkP35761 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtkP35761 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtkP35761 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtkP35761 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TtkP35761 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtkP35761 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtkP35761 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtkP35761 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtkP35761 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TtkP35761 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtkP35761 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtkP35761 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtkP35761 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtkP35761 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtkP35761 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtkP35761 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtkP35761 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtkP35761 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtkP35761 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TtkP35761 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtkP35761 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtkP35761 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtkP35761 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtkP35761 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtkP35761 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtkP35761 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtkP35761 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtkP35761 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtkP35761 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtkP35761 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtkP35761 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtkP35761 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtkP35761 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtkP35761 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtkP35761 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtkP35761 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtkP35761 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtkP35761 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtkP35761 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtkP35761 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtkP35761 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtkP35761 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtkP35761 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtkP35761 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtkP35761 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtkP35761 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtkP35761 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtkP35761 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtkP35761 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtkP35761 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtkP35761 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtkP35761 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtkP35761 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtkP35761 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtkP35761 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtkP35761 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtkP35761 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtkP35761 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtkP35761 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtkP35761 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtkP35761 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtkP35761 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtkP35761 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtkP35761 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtkP35761 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtkP35761 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtkP35761 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtkP35761 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtkP35761 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtkP35761 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtkP35761 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtkP35761 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtkP35761 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtkP35761 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtkP35761 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtkP35761 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtkP35761 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtkP35761 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtkP35761 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtkP35761 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtkP35761 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtkP35761 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms