Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab17P35292 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab17P35292 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab17P35292 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab17P35292 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab17P35292 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab17P35292 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab17P35292 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms