Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnd1P30999 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms