Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Mmp3P28862 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp3P28862 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms