Protein–RNA interactions for Protein: P28798

Grn, Granulins, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GrnP28798 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GrnP28798 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GrnP28798 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GrnP28798 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GrnP28798 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GrnP28798 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GrnP28798 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GrnP28798 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GrnP28798 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GrnP28798 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GrnP28798 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GrnP28798 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GrnP28798 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GrnP28798 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GrnP28798 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GrnP28798 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GrnP28798 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GrnP28798 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GrnP28798 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GrnP28798 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GrnP28798 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GrnP28798 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GrnP28798 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GrnP28798 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GrnP28798 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GrnP28798 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GrnP28798 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GrnP28798 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GrnP28798 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GrnP28798 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GrnP28798 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GrnP28798 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GrnP28798 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GrnP28798 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GrnP28798 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GrnP28798 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GrnP28798 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GrnP28798 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GrnP28798 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GrnP28798 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GrnP28798 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GrnP28798 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GrnP28798 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GrnP28798 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GrnP28798 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GrnP28798 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GrnP28798 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GrnP28798 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GrnP28798 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GrnP28798 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GrnP28798 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GrnP28798 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GrnP28798 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GrnP28798 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GrnP28798 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GrnP28798 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GrnP28798 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GrnP28798 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GrnP28798 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GrnP28798 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GrnP28798 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GrnP28798 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GrnP28798 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GrnP28798 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GrnP28798 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GrnP28798 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GrnP28798 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GrnP28798 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GrnP28798 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GrnP28798 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GrnP28798 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GrnP28798 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GrnP28798 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GrnP28798 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GrnP28798 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GrnP28798 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GrnP28798 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GrnP28798 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GrnP28798 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GrnP28798 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GrnP28798 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GrnP28798 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GrnP28798 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GrnP28798 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GrnP28798 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GrnP28798 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GrnP28798 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GrnP28798 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GrnP28798 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GrnP28798 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GrnP28798 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GrnP28798 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GrnP28798 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GrnP28798 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GrnP28798 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GrnP28798 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GrnP28798 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GrnP28798 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GrnP28798 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GrnP28798 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms