Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa3P28310 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa3P28310 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa3P28310 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa3P28310 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms