Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BrafP28028 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BrafP28028 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BrafP28028 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BrafP28028 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BrafP28028 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BrafP28028 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BrafP28028 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BrafP28028 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BrafP28028 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BrafP28028 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BrafP28028 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BrafP28028 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BrafP28028 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BrafP28028 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BrafP28028 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BrafP28028 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BrafP28028 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BrafP28028 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BrafP28028 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BrafP28028 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BrafP28028 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BrafP28028 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BrafP28028 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BrafP28028 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BrafP28028 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BrafP28028 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BrafP28028 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BrafP28028 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BrafP28028 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BrafP28028 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BrafP28028 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BrafP28028 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BrafP28028 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BrafP28028 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BrafP28028 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BrafP28028 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BrafP28028 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BrafP28028 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BrafP28028 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BrafP28028 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BrafP28028 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BrafP28028 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BrafP28028 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BrafP28028 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BrafP28028 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BrafP28028 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BrafP28028 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BrafP28028 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BrafP28028 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BrafP28028 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BrafP28028 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BrafP28028 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BrafP28028 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BrafP28028 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BrafP28028 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BrafP28028 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BrafP28028 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BrafP28028 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BrafP28028 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BrafP28028 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BrafP28028 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BrafP28028 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BrafP28028 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BrafP28028 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BrafP28028 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BrafP28028 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BrafP28028 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BrafP28028 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BrafP28028 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BrafP28028 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BrafP28028 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BrafP28028 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BrafP28028 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BrafP28028 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BrafP28028 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BrafP28028 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BrafP28028 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms