Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CftrP26361 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CftrP26361 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CftrP26361 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CftrP26361 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CftrP26361 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CftrP26361 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CftrP26361 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CftrP26361 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CftrP26361 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CftrP26361 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CftrP26361 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CftrP26361 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CftrP26361 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CftrP26361 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CftrP26361 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CftrP26361 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CftrP26361 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
CftrP26361 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
CftrP26361 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CftrP26361 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CftrP26361 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CftrP26361 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CftrP26361 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CftrP26361 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CftrP26361 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CftrP26361 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CftrP26361 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CftrP26361 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CftrP26361 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CftrP26361 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CftrP26361 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CftrP26361 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CftrP26361 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CftrP26361 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CftrP26361 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CftrP26361 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CftrP26361 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CftrP26361 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CftrP26361 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CftrP26361 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CftrP26361 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CftrP26361 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CftrP26361 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CftrP26361 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CftrP26361 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CftrP26361 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CftrP26361 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CftrP26361 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CftrP26361 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CftrP26361 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CftrP26361 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CftrP26361 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CftrP26361 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CftrP26361 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CftrP26361 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CftrP26361 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CftrP26361 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CftrP26361 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CftrP26361 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CftrP26361 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CftrP26361 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CftrP26361 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CftrP26361 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CftrP26361 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CftrP26361 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CftrP26361 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CftrP26361 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CftrP26361 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CftrP26361 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CftrP26361 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CftrP26361 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CftrP26361 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CftrP26361 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CftrP26361 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CftrP26361 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CftrP26361 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CftrP26361 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CftrP26361 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CftrP26361 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CftrP26361 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CftrP26361 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CftrP26361 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CftrP26361 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CftrP26361 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CftrP26361 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CftrP26361 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CftrP26361 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CftrP26361 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CftrP26361 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CftrP26361 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CftrP26361 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CftrP26361 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CftrP26361 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CftrP26361 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CftrP26361 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CftrP26361 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CftrP26361 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CftrP26361 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CftrP26361 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms