Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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