Protein–RNA interactions for Protein: P23804

Mdm2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm2P23804 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mdm2P23804 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms