Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja1P23242 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja1P23242 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja1P23242 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja1P23242 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja1P23242 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja1P23242 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms