Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms