Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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