Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc1P18828 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms