Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18529 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18529 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18529 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18529 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18529 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18529 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P18529 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18529 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18529 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18529 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18529 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18529 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18529 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18529 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18529 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18529 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18529 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18529 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18529 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18529 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18529 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18529 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18529 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18529 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18529 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18529 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18529 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18529 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18529 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18529 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18529 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18529 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18529 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18529 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P18529 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P18529 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P18529 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P18529 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18529 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18529 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18529 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18529 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18529 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18529 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18529 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18529 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18529 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18529 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18529 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18529 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18529 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18529 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18529 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18529 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18529 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18529 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18529 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18529 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18529 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18529 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18529 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18529 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18529 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18529 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18529 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18529 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18529 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18529 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18529 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18529 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18529 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18529 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18529 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18529 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18529 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18529 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18529 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18529 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18529 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18529 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18529 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18529 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18529 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18529 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18529 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18529 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18529 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18529 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18529 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P18529 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P18529 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18529 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18529 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18529 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18529 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18529 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18529 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18529 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18529 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms